Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRPF4BQ13523 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF4BQ13523 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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