Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Msx2Q03358 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx2Q03358 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms