Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms