Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Copz1P61924 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copz1P61924 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Copz1P61924 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Copz1P61924 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms