Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa2P31245 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa2P31245 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms