Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMB4P28070 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms