Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NdnP25233 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NdnP25233 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NdnP25233 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NdnP25233 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NdnP25233 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NdnP25233 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NdnP25233 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NdnP25233 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
NdnP25233 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NdnP25233 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NdnP25233 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NdnP25233 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NdnP25233 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NdnP25233 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NdnP25233 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
NdnP25233 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NdnP25233 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NdnP25233 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NdnP25233 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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NdnP25233 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NdnP25233 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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