Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTPS1P17812 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms