Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTAP09496 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTAP09496 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTAP09496 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTAP09496 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTAP09496 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTAP09496 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTAP09496 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTAP09496 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTAP09496 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTAP09496 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTAP09496 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTAP09496 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTAP09496 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLTAP09496 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLTAP09496 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLTAP09496 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLTAP09496 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTAP09496 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTAP09496 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLTAP09496 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTAP09496 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTAP09496 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTAP09496 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTAP09496 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTAP09496 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTAP09496 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTAP09496 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTAP09496 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTAP09496 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTAP09496 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTAP09496 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTAP09496 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTAP09496 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLTAP09496 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms