Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtcflA2APF3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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