Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttll9A2APC3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttll9A2APC3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms