Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 GLRX-202ENST00000379979 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 GPM6B-210ENST00000493677 1372 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ZNF85-202ENST00000328178 2296 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LAX1-202ENST00000367217 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 GSTM1-203ENST00000369819 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 PPP1R7-204ENST00000402734 883 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SLC25A5P7-201ENST00000406156 896 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC092042.2-201ENST00000417304 331 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AL355516.1-201ENST00000422082 746 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 PAICSP1-201ENST00000425324 1217 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 RPL5P6-201ENST00000425640 886 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 RPL3P8-201ENST00000432928 1191 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AL122003.1-201ENST00000435206 784 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AL606804.1-202ENST00000446347 481 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC013264.1-201ENST00000449346 455 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 RBM22P5-201ENST00000449536 1277 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC013439.1-201ENST00000449965 1239 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 EIPR1-IT1-201ENST00000454977 718 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 RPL5P17-201ENST00000469685 877 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC008638.2-201ENST00000503840 715 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC02058-201ENST00000507491 707 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC083902.1-201ENST00000508578 359 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC01094-206ENST00000514130 594 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CAMK2D-213ENST00000514328 1497 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC114550.1-201ENST00000518846 573 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 MTND6P19-201ENST00000519399 524 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC087269.1-201ENST00000522213 666 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC091820.1-201ENST00000523497 648 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC01608-202ENST00000524283 561 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AP001636.1-201ENST00000531997 1122 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AP003032.2-201ENST00000533697 686 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC02455-201ENST00000541881 496 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 COX4I1P1-201ENST00000554239 509 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CIPC-206ENST00000555611 599 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC109460.4-201ENST00000561471 454 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC007495.1-202ENST00000565155 559 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC009118.1-201ENST00000566019 374 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC068152.1-202ENST00000571901 808 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC098850.2-201ENST00000578710 686 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 MIR3714-201ENST00000579507 65 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC108704.1-201ENST00000611714 744 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 GSTTP1-204ENST00000621179 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 PCBP1-AS1-322ENST00000628147 553 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 FHL1-230ENST00000630084 1335 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 MMP20-201ENST00000260228 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CCDC63-204ENST00000552694 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CNPY1-204ENST00000636446 1637 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms