Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00574Q9H8X3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms