Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms