Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slco1c1Q9ERB5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slco1c1Q9ERB5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slco1c1Q9ERB5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slco1c1Q9ERB5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slco1c1Q9ERB5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slco1c1Q9ERB5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slco1c1Q9ERB5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slco1c1Q9ERB5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slco1c1Q9ERB5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slco1c1Q9ERB5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slco1c1Q9ERB5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slco1c1Q9ERB5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms