Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc91Q9D8L5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms