Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
UPF3BQ9BZI7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms