Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E2Q96LR5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBE2E2Q96LR5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms