Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGBD1Q96JS3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms