Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtl5Q5DTT4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtl5Q5DTT4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms