Protein–RNA interactions for Protein: Q03530

RCE1, CAAX prenyl protease 2, yeastyeast

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RCE1Q03530 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 URM1YIL008W 300 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 NFU1YKL040C 771 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 MRPL31YKL138C 396 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YBR012CYBR012C 420 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 TSC3YBR058C-A 243 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 STO1YMR125W 2586 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 PRP16YKR086W 3216 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YDL073WYDL073W 2955 nt0.6□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.6□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 STE18YJR086W 333 nt0.6□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YMR160WYMR160W 2451 nt0.6□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 FIG4YNL325C 2640 nt0.6□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 RFX1YLR176C 2436 nt0.59□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YCR001WYCR001W 315 nt0.59□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 WIP1YDR374W-A 270 nt0.59□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 UPS1YLR193C 528 nt0.59□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 CDC33YOL139C 642 nt0.59□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YGR042WYGR042W 816 nt0.58□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 YNR025CYNR025C 360 nt0.58□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 LCD1YDR499W 2244 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 YDL196WYDL196W 330 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 MXR1YER042W 555 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 EMC4YGL231C 573 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 YOR199WYOR199W 330 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 SLY1YDR189W 2001 nt0.57□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 SWF1YDR126W 1011 nt0.56□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 BIG1YHR101C 1008 nt0.56□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.56□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 RRT1YBL048W 312 nt0.56□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 PBI2YNL015W 228 nt0.56□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 ALY2YJL084C 3141 nt0.56□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 UTP20YBL004W 7482 nt0.56□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 YDR269CYDR269C 324 nt0.55□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 AIM29YKR074W 468 nt0.55□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.55□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 YDL206WYDL206W 2289 nt0.55□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 SWI6YLR182W 2412 nt0.55□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.54□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 EAF6YJR082C 342 nt0.54□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 PDE2YOR360C 1581 nt0.53□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 MYO1YHR023W 5787 nt0.53□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 NPC2YDL046W 522 nt0.53□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 YIL059CYIL059C 366 nt0.53□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 YPR153WYPR153W 423 nt0.53□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.53□□□□□ -2.32
RCE1Q03530 GEA2YEL022W 4380 nt0.52□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.52□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 snR72snR72 98 nt0.51□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 YML108WYML108W 318 nt0.51□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 SLI15YBR156C 2097 nt0.51□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 AIM44YPL158C 2277 nt0.5□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 ZIP2YGL249W 2115 nt0.5□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 MMS4YBR098W 2076 nt0.5□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 LTE1YAL024C 4308 nt0.5□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 YJL135WYJL135W 318 nt0.5□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.5□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.5□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 YML002WYML002W 2214 nt0.5□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 WAR1YML076C 2835 nt0.5□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 BFR2YDR299W 1605 nt0.49□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 YCK3YER123W 1575 nt0.49□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 ALG13YGL047W 609 nt0.49□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 TIM13YGR181W 318 nt0.49□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 QCR9YGR183C 201 nt0.49□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 FYV7YLR068W 456 nt0.49□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 YBL071CYBL071C 309 nt0.49□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 YPL182CYPL182C 384 nt0.49□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 EFR3YMR212C 2349 nt0.49□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 YGR290WYGR290W 444 nt0.48□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 YHR125WYHR125W 306 nt0.48□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.48□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 UBC7YMR022W 498 nt0.48□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 ZEO1YOL109W 342 nt0.48□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 LOA1YPR139C 903 nt0.48□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 UTP10YJL109C 5310 nt0.48□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 PAU12YGR294W 363 nt0.47□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.47□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.47□□□□□ -2.33
RCE1Q03530 RIM20YOR275C 1986 nt0.46□□□□□ -2.34
RCE1Q03530 YDL011CYDL011C 324 nt0.46□□□□□ -2.34
RCE1Q03530 YDL158CYDL158C 309 nt0.46□□□□□ -2.34
RCE1Q03530 BI2Q0110 1272 nt0.46□□□□□ -2.34
RCE1Q03530 YNL122CYNL122C 348 nt0.46□□□□□ -2.34
RCE1Q03530 RPB10YOR210W 213 nt0.46□□□□□ -2.34
RCE1Q03530 YOR218CYOR218C 420 nt0.46□□□□□ -2.34
RCE1Q03530 YHL041WYHL041W 450 nt0.45□□□□□ -2.34
RCE1Q03530 RPS27AYKL156W 249 nt0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.7 ms