Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFAMQ00059 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 422.7 ms