Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gp1bbP56400 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gp1bbP56400 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms