Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mmp9P41245 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mmp9P41245 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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