Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CLIP1P30622 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CLIP1P30622 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CLIP1P30622 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CLIP1P30622 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLIP1P30622 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLIP1P30622 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLIP1P30622 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CLIP1P30622 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CLIP1P30622 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CLIP1P30622 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CLIP1P30622 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLIP1P30622 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLIP1P30622 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
CLIP1P30622 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CLIP1P30622 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CLIP1P30622 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms