Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTDNEP1O95476 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTDNEP1O95476 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms