Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ccdc179J3QM76 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms