Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim15G3UY57 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms