Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r167G3UW71 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r167G3UW71 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms