Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AP000997.1-201ENST00000424313 479 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL122003.1-201ENST00000435206 784 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL138881.1-201ENST00000443445 789 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL161937.1-202ENST00000451960 341 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RN7SL598P-201ENST00000494391 294 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RPL4P1-201ENST00000496596 1278 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC114786.3-201ENST00000509304 705 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC015909.1-201ENST00000509943 839 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC091901.1-201ENST00000517722 736 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 GSG1-206ENST00000537302 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC016954.1-201ENST00000549976 745 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL356800.1-201ENST00000553339 735 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL023284.4-201ENST00000564248 374 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 HLA-P-207ENST00000568192 747 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC027763.2-201ENST00000573755 539 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AP001021.2-201ENST00000577935 544 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC091147.1-201ENST00000583290 510 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AP005131.4-202ENST00000590468 570 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ZNF559-ZNF177-205ENST00000602856 419 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC108704.1-201ENST00000611714 744 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC090099.1-204ENST00000623626 849 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC012100.3-201ENST00000624738 575 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL133464.1-204ENST00000634280 1094 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MIR3191-201ENST00000636300 76 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SPRY1-202ENST00000394339 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 UGT2B28-202ENST00000511240 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LMLN-202ENST00000332636 1812 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 STMND1-203ENST00000536551 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 AC107419.1-201ENST00000422048 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 COPS4-201ENST00000264389 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 AC104699.1-201ENST00000352271 414 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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PDCD1Q15116 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC073648.1-201ENST00000508957 930 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OR7E85P-201ENST00000512164 985 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 STMN2-203ENST00000518491 585 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CRYAB-212ENST00000533280 545 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AP006296.1-201ENST00000537438 499 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 OTX2-204ENST00000554788 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 SAXO2-204ENST00000565432 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 TEX51-207ENST00000568484 731 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AC015878.2-201ENST00000584331 361 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 CD209-211ENST00000602261 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PDCD1Q15116 AL031772.1-216ENST00000619494 697 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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