Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Dsg1bQ7TSF1 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Dsg1bQ7TSF1 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Dsg1bQ7TSF1 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Dsg1bQ7TSF1 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Dsg1bQ7TSF1 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Dsg1bQ7TSF1 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Dsg1bQ7TSF1 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Dsg1bQ7TSF1 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Dsg1bQ7TSF1 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Dsg1bQ7TSF1 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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