Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms