Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMM50Q9Y512 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMM50Q9Y512 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms