Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVW-1Q9UQF0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms