Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mis12Q9CY25 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mis12Q9CY25 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms