Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRCC1Q9C099 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms