Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPIRE2Q8WWL2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms