Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc115Q8VE99 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms