Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cmc2Q8K199 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cmc2Q8K199 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cmc2Q8K199 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cmc2Q8K199 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cmc2Q8K199 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cmc2Q8K199 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cmc2Q8K199 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cmc2Q8K199 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cmc2Q8K199 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmc2Q8K199 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cmc2Q8K199 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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