Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBH1

Rassf5, Ras association domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf5Q5EBH1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rassf5Q5EBH1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms