Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2al1nQ497L1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2al1nQ497L1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms