Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rtel1Q0VGM9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rtel1Q0VGM9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms