Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRCDQ00LT1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms