Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP11P51784 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP11P51784 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP11P51784 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP11P51784 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP11P51784 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP11P51784 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP11P51784 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP11P51784 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP11P51784 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP11P51784 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP11P51784 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP11P51784 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP11P51784 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP11P51784 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP11P51784 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP11P51784 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP11P51784 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP11P51784 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP11P51784 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP11P51784 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP11P51784 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP11P51784 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP11P51784 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP11P51784 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP11P51784 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP11P51784 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP11P51784 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP11P51784 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP11P51784 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP11P51784 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP11P51784 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP11P51784 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP11P51784 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP11P51784 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP11P51784 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP11P51784 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP11P51784 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP11P51784 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP11P51784 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP11P51784 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP11P51784 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP11P51784 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP11P51784 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP11P51784 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms