Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpbP27790 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpbP27790 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpbP27790 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpbP27790 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms