Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb6Q9Z0T9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms