Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CDC42EP3Q9UKI2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC42EP3Q9UKI2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms