Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc83Q9D4V3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc83Q9D4V3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms