Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pfdn1Q9CWM4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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