Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ22

Lamtor1, Ragulator complex protein LAMTOR1, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamtor1Q9CQ22 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamtor1Q9CQ22 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamtor1Q9CQ22 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamtor1Q9CQ22 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamtor1Q9CQ22 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms